primer extension

primer extension
Technique for finding the transcriptional start site of a gene. mRNAs cannot be relied on to be complete at the 5&’ end, so a labelled antisense oligonucleotide primer is designed to complement the putative mRNA near its 5&’ end, and used to prime a reverse transcription reaction. The products are run on a sequencing gel, and the lengths of products allow the putative start sites to be deduced.

Dictionary of molecular biology. 2004.

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